siddharthtumre/JNLPBA-Processed · Datasets at Hugging Face

id stringlengths 1 5	tokens list	ner_tags list
4201	[ "In", "Rel", "-", "/", "-", "splenic", "T", "cell", "cultures", "stimulated", "with", "phorbol", "12", "-", "myristate", "13", "-", "acetate", "and", "ionomycin", ",", "the", "levels", "of", "IL", "-", "3", ",", "IL", "-", "5", ",", "granulocyte", "-", "macrophage", "colony", "-", "stimulating", "factor", "(", "GM", "-", "CSF", ")", ",", "tumor", "necrosis", "factor", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", ",", "and", "gamma", "interferon", "(", "IFN", "-", "gamma", ")", "were", "only", "2", "-", "to", "3", "-", "fold", "lower", "compared", "with", "normal", "T", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4202	[ "In", "contrast", ",", "anti", "-", "CD3", "and", "anti", "-", "CD28", "stimulated", "Rel", "-", "/", "-", "T", "cells", ",", "which", "fail", "to", "proliferate", ",", "make", "little", "or", "no", "detectable", "cytokines", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]
4203	[ "In", "contrast", "to", "mitogen", "-", "activated", "Rel", "-", "/", "-", "T", "cells", ",", "lipopolysaccharide", "-", "stimulated", "Rel", "-", "/", "-", "macrophages", "produce", "higher", "than", "normal", "levels", "of", "GM", "-", "CSF", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
4204	[ "Activation", "of", "T", "lymphocytes", "requires", "the", "combined", "signaling", "of", "the", "T", "cell", "receptor", "and", "costimulatory", "molecules", "such", "as", "CD28", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "O" ]
4205	[ "The", "ability", "of", "T", "cells", "to", "produce", "interleukin", "-", "2", "(", "IL", "-", "2", ")", "is", "a", "critical", "control", "point", "in", "T", "lymphocyte", "activation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4206	[ "The", "IL", "-", "2", "enhancer", "contains", "a", "functional", "motif", "named", "CD28", "response", "element", "(", "CD28RE", ")", "that", "serves", "a", "role", "as", "a", "target", "for", "mitogenic", "T", "cell", "activation", "signals", "." ]	[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4207	[ "The", "CD28RE", "sequence", "reveals", "similarity", "to", "the", "consensus", "kappaB", "binding", "motif", "." ]	[ "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
4208	[ "Here", "we", "demonstrate", "that", "CD28RE", "binds", "an", "inducible", "protein", "with", "a", "molecular", "mass", "of", "approximately", "35", "kDa", "called", "nuclear", "factor", "of", "mitogenic", "-", "activated", "T", "cells", "(", "NF", "-", "MATp35", ")", "that", "is", "clearly", "different", "from", "the", "known", "NF", "-", "kappaB", "/", "Rel", "family", "members", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]
4209	[ "Induction", "of", "NF", "-", "MATp35", "was", "shown", "to", "depend", "on", "de", "novo", "protein", "synthesis", "and", "was", "restricted", "to", "T", "cells", "that", "received", "a", "mitogenic", "combination", "of", "T", "cell", "stimuli", ",", "not", "necessarily", "including", "CD28", "signaling", "." ]	[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]
4210	[ "Nonmitogenic", "T", "cell", "stimulation", "did", "not", "result", "in", "appearance", "of", "NF", "-", "MATp35", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
4211	[ "Similar", "to", "its", "effect", "on", "IL", "-", "2", "production", ",", "cyclosporin", "A", "inhibited", "the", "induction", "of", "NF", "-", "MATp35", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
4212	[ "Taken", "together", ",", "these", "data", "demonstrate", "that", "the", "nuclear", "appearance", "of", "NF", "-", "MATp35", "shows", "excellent", "correlation", "with", "IL", "-", "2", "production", ",", "which", "is", "a", "unique", "characteristic", "among", "nuclear", "factors", "implicated", "in", "the", "control", "of", "IL", "-", "2", "gene", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O" ]
4213	[ "The", "work", "reported", "here", "resolves", ",", "at", "the", "level", "of", "gene", "regulation", ",", "the", "controversy", "as", "to", "whether", "or", "not", "human", "monocytes", "/", "macrophages", "can", "produce", "nitric", "oxide", "(", "NO", ")", "when", "stimulated", "with", "lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", ",", "with", "or", "without", "co", "-", "stimulation", "by", "interferon", "-", "gamma", "(", "IFN", "-", "gamma", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
4214	[ "Studies", "included", "structural", "comparison", "of", "the", "promoters", "for", "human", "and", "mouse", "inducible", "NO", "synthase", "(", "iNOS", ")", "genes", ",", "transfection", "and", "assay", "of", "human", "and", "mouse", "iNOS", "promoter", "regions", "in", "response", "to", "LPS", "+", "/", "-", "IFN", "-", "gamma", ",", "and", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "of", "kappa", "B", "response", "elements", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
4215	[ "The", "importance", "of", "resolution", "of", "this", "controversy", "is", "that", "future", "research", "in", "this", "area", "should", "be", "directed", "toward", "the", "understanding", "of", "alternative", "mechanisms", "that", "can", "result", "in", "the", "successful", "production", "of", "NO", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4216	[ "X", "inactivation", "analysis", "in", "a", "female", "with", "hypomelanosis", "of", "Ito", "associated", "with", "a", "balanced", "X", ";", "17", "translocation", ":", "evidence", "for", "functional", "disomy", "of", "Xp", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4217	[ "X", "inactivation", "analysis", "was", "performed", "on", "normal", "and", "hypopigmented", "skin", "samples", "obtained", "from", "a", "female", "with", "hypomelanosis", "of", "Ito", "associated", "with", "a", "balanced", "whole", "arm", "X", ";", "17", "translocation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]
4218	[ "In", "addition", ",", "dual", "colour", "FISH", "analysis", "using", "centromere", "specific", "probes", "for", "chromosomes", "X", "and", "17", "showed", "that", "the", "breakpoints", "on", "both", "chromosomes", "lie", "within", "the", "alphoid", "arrays", ",", "making", "interruption", "of", "a", "locus", "on", "either", "chromosome", "unlikely", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4219	[ "Identification", "of", "a", "herpesvirus", "Saimiri", "cis", "-", "acting", "DNA", "fragment", "that", "permits", "stable", "replication", "of", "episomes", "in", "transformed", "T", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4220	[ "Herpesvirus", "saimiri", "is", "a", "lymphotropic", "herpesvirus", "capable", "of", "immortalizing", "and", "transforming", "T", "cells", "both", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4221	[ "Immortalized", "and", "transformed", "T", "cells", "harbor", "several", "copies", "of", "the", "viral", "genome", "as", "a", "persisting", "genome", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "O" ]
4222	[ "The", "mapping", "of", "the", "cis", "-", "acting", "genetic", "cis", "-", "acting", "segment", "(", "oriP", ")", "required", "for", "viral", "episomal", "maintenance", "is", "reported", "here", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4223	[ "Viral", "DNA", "fragments", "that", "potentially", "contain", "oriP", "were", "cloned", "into", "a", "plasmid", "that", "contains", "the", "hygromycin", "resistance", "gene", "." ]	[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
4224	[ "This", "viral", "fragment", "permits", "stable", "plasmid", "replication", "without", "deletion", "or", "rearrangement", "as", "well", "as", "episomal", "maintenance", "without", "integration", "or", "recombination", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4225	[ "The", "function", "of", "oriP", "depends", "on", "a", "trans", "-", "acting", "factor", "(", "s", ")", "encoded", "by", "the", "viral", "genome", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]
4226	[ "The", "1", ".", "955", "-", "kb", "viral", "segment", "includes", "a", "dyad", "symmetry", "region", "located", "between", "two", "small", "nuclear", "RNA", "genes", "and", "is", "located", "upstream", "of", "the", "dihydrofolate", "reductase", "gene", "homolog", "." ]	[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
4227	[ "Therefore", ",", "this", "oriP", "contains", "novel", "elements", "distinct", "from", "those", "of", "other", "DNA", "viruses", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4228	[ "In", "vivo", "anergized", "CD4", "+", "T", "cells", "express", "perturbed", "AP", "-", "1", "and", "NF", "-", "kappa", "B", "transcription", "factors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "B", "I", "O" ]
4229	[ "Anergy", "is", "a", "major", "mechanism", "to", "ensure", "antigen", "-", "specific", "tolerance", "in", "T", "lymphocytes", "in", "the", "adult", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4230	[ "In", "vivo", ",", "anergy", "has", "mainly", "been", "studied", "at", "the", "cellular", "level", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4231	[ "In", "this", "study", ",", "we", "used", "the", "T", "-", "cell", "-", "activating", "superantigen", "staphylococcal", "enterotoxin", "A", "(", "SEA", ")", "to", "investigate", "molecular", "mechanisms", "of", "T", "-", "lymphocyte", "anergy", "in", "vivo", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4232	[ "Injection", "of", "SEA", "to", "adult", "mice", "activates", "CD4", "+", "T", "cells", "expressing", "certain", "T", "-", "cell", "receptor", "(", "TCR", ")", "variable", "region", "beta", "-", "chain", "families", "and", "induces", "strong", "and", "rapid", "production", "of", "interleukin", "2", "(", "IL", "-", "2", ")", "." ]	[ "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
4233	[ "In", "contrast", ",", "repeated", "injections", "of", "SEA", "cause", "CD4", "+", "T", "-", "cell", "deletion", "and", "anergy", "in", "the", "remaining", "CD4", "+", "T", "cells", ",", "characterized", "by", "reduced", "expression", "of", "IL", "-", "2", "at", "mRNA", "and", "protein", "levels", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4234	[ "We", "analyzed", "expression", "of", "AP", "-", "1", ",", "NF", "-", "kappa", "B", ",", "NF", "-", "AT", ",", "and", "octamer", "binding", "transcription", "factors", ",", "which", "are", "known", "to", "be", "involved", "in", "the", "regulation", "of", "IL", "-", "2", "gene", "promoter", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]
4235	[ "In", "contrast", ",", "anergic", "CD4", "+", "T", "cells", "contained", "severely", "reduced", "levels", "of", "AP", "-", "1", "and", "Fos", "/", "Jun", "-", "containing", "NF", "-", "AT", "complexes", "but", "expressed", "significant", "amounts", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "and", "Oct", "binding", "proteins", "after", "SEA", "stimulation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O" ]
4236	[ "Resolution", "of", "the", "NF", "-", "kappa", "B", "complex", "demonstrated", "predominant", "expression", "of", "p50", "-", "p65", "heterodimers", "in", "activated", "CD4", "+", "T", "cells", ",", "while", "anergic", "cells", "mainly", "expressed", "the", "transcriptionally", "inactive", "p50", "homodimer", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]
4237	[ "These", "alterations", "of", "transcription", "factors", "are", "likely", "to", "be", "responsible", "for", "repression", "of", "IL", "-", "2", "in", "anergic", "T", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4238	[ "Stimulation", "through", "the", "Fas", "/", "APO", "-", "1", "receptor", "results", "in", "apoptosis", "through", "an", "incompletely", "characterized", "signaling", "pathway", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4239	[ "It", "has", "been", "shown", "that", "TCR", "stimulation", "requires", "both", "the", "membrane", "tyrosine", "phosphatase", ",", "CD45", ",", "and", "the", "Src", "-", "family", "kinase", ",", "Lck", ",", "to", "result", "in", "cellular", "activation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4240	[ "Further", ",", "in", "normal", "and", "CD45", "-", "or", "Lck", "-", "deficient", "cell", "lines", ",", "Fas", "stimulation", "results", "in", "activation", "of", "Jun", "kinase", "(", "JNK", ")", ",", "a", "proposed", "mediator", "of", "stress", "activation", "pathways", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4241	[ "Previous", "studies", "have", "also", "demonstrated", "a", "role", "for", "endogenous", "ceramide", "release", "in", "Fas", "-", "mediated", "apoptosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4242	[ "We", "show", "that", "stimulation", "with", "a", "synthetic", "ceramide", "analog", "results", "in", "JNK", "activation", "as", "well", "as", "apoptosis", ",", "suggesting", "ceramide", "release", "occurs", "proximal", "to", "JNK", "activation", "in", "Fas", "signaling", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "O", "O" ]
4243	[ "Our", "data", "suggest", "that", "although", "CD45", "and", "Lck", "are", "not", "required", "for", "Fas", "signaling", ",", "JNK", "activation", "may", "play", "an", "important", "role", "transducing", "distal", "signals", "that", "lead", "to", "apoptosis", "after", "Fas", "ligation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]
4244	[ "In", "vivo", "protein", "-", "DNA", "interactions", "of", "the", "human", "beta", "-", "globin", "locus", "in", "erythroid", "cells", "expressing", "the", "fetal", "or", "the", "adult", "globin", "gene", "program", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O" ]
4245	[ "To", "characterize", "the", "protein", "-", "DNA", "interactions", "important", "for", "the", "developmental", "control", "of", "the", "human", "beta", "-", "globin", "locus", ",", "we", "analyzed", "by", "in", "vivo", "dimethyl", "sulfate", "footprinting", "erythroid", "cells", "expressing", "either", "the", "fetal", "or", "the", "adult", "globin", "developmental", "program", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4246	[ "In", "the", "locus", "control", "region", "(", "LCR", ")", "of", "the", "beta", "-", "globin", "locus", ",", "in", "vivo", "footprints", "on", "NF", "-", "E2", "(", "or", "AP", "-", "1", ")", "and", "GATA", "-", "1", "motifs", "remained", "the", "same", "regardless", "of", "whether", "the", "fetal", "or", "the", "adult", "globin", "genes", "are", "expressed", "." ]	[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O" ]
4247	[ "In", "promoter", "regions", ",", "the", "actively", "transcribed", "genes", "demonstrated", "extensive", "and", "consistent", "footprints", "over", "the", "canonical", "elements", ",", "such", "as", "CACCC", "and", "CCAAT", "motifs", "." ]	[ "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
4248	[ "The", "adult", "globin", "expressing", "cells", "displayed", "more", "extensive", "footprints", "than", "the", "fetal", "globin", "expressing", "cells", "in", "the", "3", "'", "regulatory", "sequences", "of", "both", "the", "Agamma", "-", "and", "the", "beta", "-", "globin", "genes", ",", "suggesting", "a", "role", "of", "these", "3", "'", "elements", "in", "beta", "-", "globin", "gene", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O" ]
4249	[ "Our", "results", "suggest", "that", "the", "bulk", "of", "protein", "-", "DNA", "interactions", "that", "underlies", "the", "developmental", "control", "of", "globin", "genes", "takes", "place", "in", "the", "gamma", "-", "and", "beta", "-", "globin", "gene", "promoters", ",", "and", "that", "GT", "motifs", "of", "the", "beta", "-", "globin", "locus", "LCR", "may", "play", "a", "role", "in", "the", "developmental", "regulation", "of", "human", "beta", "-", "globin", "gene", "expression", ",", "perhaps", "by", "increasing", "the", "probability", "of", "interaction", "of", "the", "LCR", "holocomplex", "with", "the", "fetal", "or", "the", "adult", "globin", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]
4250	[ "Antisense", "inhibition", "of", "vitamin", "D", "receptor", "expression", "induces", "apoptosis", "in", "monoblastoid", "U937", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4251	[ "These", "effects", "are", "controlled", "by", "the", "vitamin", "D", "receptor", "(", "VDR", ")", ",", "a", "member", "of", "the", "steroid", "hormone", "receptor", "family", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
4252	[ "The", "objective", "of", "this", "study", "was", "to", "develop", "U937", "transfectants", "expressing", "antisense", "VDR", "mRNA", ",", "and", "to", "use", "these", "to", "examine", "the", "role", "of", "1", ",", "25", "(", "OH", ")", "2D3", "-", "VDR", "interaction", "in", "this", "lineage", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4253	[ "A", "2", "-", "kb", "VDR", "cDNA", "insert", "(", "including", "the", "complete", "VDR", "coding", "region", ")", "was", "cloned", "in", "an", "antisense", "orientation", "into", "the", "EBV", "episomal", "vector", "pMEP4", "under", "the", "control", "of", "an", "inducible", "promoter", "and", "transfected", "into", "U937", "." ]	[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4254	[ "The", "resultant", "cell", "line", ",", "DH42", ",", "was", "hygromycin", "resistant", ",", "contained", "VDR", "cDNA", ",", "expressed", "fewer", "VDRs", "than", "controls", ",", "and", "showed", "a", "substantial", "decrease", "in", "antiproliferative", "response", "to", "1", ",", "25", "(", "OH", ")", "2D3", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4255	[ "However", ",", "1", ",", "25", "(", "OH", ")", "2D3", "increased", "the", "number", "of", "cells", "expressing", "macrophage", "cell", "surface", "Ags", ",", "including", "CD14", "and", "CD11b", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "O", "B", "O" ]
4256	[ "A", "subpopulation", "of", "smaller", "cells", "did", "not", "express", "the", "differentiation", "markers", "after", "cadmium", "stimulation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4257	[ "A", "considerable", "proportion", "of", "cells", "were", "outside", "the", "cycle", "and", "DNA", "fragmentation", "confirmed", "apoptosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4258	[ "Thus", ",", "the", "functional", "outcome", "of", "the", "VDR", "antisense", "transfection", "suggests", "that", "in", "the", "myelomonocytic", "lineage", ",", "VDR", "expression", "may", "act", "as", "a", "protective", "mechanism", "against", "programmed", "cell", "death", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4259	[ "Human", "T", "lymphotropic", "virus", "-", "I", "infection", "of", "human", "T", "lymphocytes", "induces", "expression", "of", "the", "beta", "-", "galactoside", "-", "binding", "lectin", ",", "galectin", "-", "3", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O" ]
4260	[ "Animal", "lectins", "play", "important", "roles", "in", "a", "variety", "of", "biological", "processes", "via", "their", "recognition", "of", "glycoconjugates", "." ]	[ "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4261	[ "Galectin", "-", "3", "is", "a", "beta", "-", "galactoside", "-", "binding", "lectin", "previously", "designated", "as", "epsilon", "BP", "(", "IgE", "-", "binding", "protein", ")", ",", "CBP35", ",", "Mac", "-", "2", ",", "L", "-", "29", ",", "and", "L", "-", "34", ",", "and", "its", "expression", "has", "been", "associated", "with", "various", "physiological", "and", "pathological", "processes", ",", "including", "cell", "growth", ",", "tumor", "transformation", ",", "and", "metastasis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4262	[ "Galectin", "-", "3", "is", "widely", "distributed", "in", "various", "tissues", "and", "cell", "types", "and", "is", "expressed", "in", "many", "leukocytes", ",", "with", "the", "notable", "exception", "of", "B", "and", "T", "lymphocytes", "." ]	[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4263	[ "We", "now", "report", "that", "galectin", "-", "3", "is", "abundantly", "expressed", "in", "a", "number", "of", "human", "T", "lymphotropic", "virus", "(", "HTLV", ")", "-", "I", "-", "infected", "human", "T", "cell", "lines", ",", "including", "F6T", ",", "HUT", "102", ",", "K3T", ",", "MT", "-", "2", ",", "and", "SLB", "-", "I", ",", "but", "is", "not", "expressed", "in", "non", "-", "HTLV", "-", "I", "-", "infected", "T", "cell", "lines", "such", "as", "Jurkat", ",", "CEM", ",", "and", "MOLT", "-", "4", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4264	[ "In", "addition", ",", "the", "galectin", "-", "3", "level", "was", "markedly", "increased", "in", "human", "thymocytes", "after", "infection", "with", "HTLV", "-", "I", "as", "compared", "with", "uninfected", "thymocytes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4265	[ "The", "up", "-", "regulation", "of", "galectin", "-", "3", "expression", "appeared", "to", "correlate", "well", "with", "HTLV", "-", "I", "gene", "expression", ",", "as", "undetectable", "or", "very", "low", "levels", "of", "galectin", "-", "3", "were", "found", "in", "the", "S1T", "and", "ATL", "-", "1K", "cell", "lines", ",", "which", "are", "nonproductively", "infected", "with", "HTLV", "-", "I", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4266	[ "In", "co", "-", "transfection", "experiments", ",", "the", "galectin", "-", "3", "promoter", "was", "significantly", "up", "-", "regulated", "by", "expression", "vectors", "encoding", "the", "40", "-", "kd", "Tax", "protein", ",", "a", "potent", "transactivator", "in", "HTLV", "-", "I", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4267	[ "Analysis", "of", "various", "Tax", "mutants", "suggested", "that", "galectin", "-", "3", "promoter", "induction", "is", "dependent", "on", "activation", "of", "the", "cyclic", "-", "AMP", "-", "responsive", "element", "binding", "protein", "/", "activation", "transcription", "factor", "family", "of", "transcription", "factors", "and", ",", "to", "a", "lesser", "extent", ",", "nuclear", "factor", "-", "kappa", "B", "/", "Rel", "induction", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O" ]
4268	[ "Transfection", "of", "human", "promonocytic", "U", "-", "937", "cells", "with", "an", "HTLV", "-", "I", "Tax", "expression", "vector", "induced", "galectin", "-", "3", "expression", "in", "this", "cell", "line", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4269	[ "Functionally", ",", "galectin", "-", "3", "was", "shown", "to", "activate", "interleukin", "-", "2", "production", "in", "Jurkat", "T", "cells", "." ]	[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4270	[ "Together", ",", "these", "findings", "raise", "the", "possibility", "that", "HTLV", "-", "I", "Tax", "production", "induces", "the", "transcription", "and", "subsequent", "synthesis", "and", "secretion", "of", "galectin", "-", "3", ",", "which", "in", "turn", "may", "further", "activate", "these", "T", "cells", "and", "contribute", "to", "the", "altered", "properties", "of", "cell", "growth", "found", "in", "adult", "T", "cell", "leukemia", "induced", "by", "HTLV", "-", "I", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4271	[ "Monocytic", "cell", "type", "-", "specific", "transcriptional", "induction", "of", "collagenase", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]
4272	[ "Interstitial", "collagenase", "(", "MMP", "-", "1", ")", ",", "a", "metalloproteinase", "produced", "by", "resident", "and", "inflammatory", "cells", "during", "connective", "tissue", "turnover", ",", "cleaves", "type", "I", "collagen", "fibrils", "." ]	[ "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
4273	[ "This", "catalytic", "event", "is", "rate", "limiting", "in", "remodeling", "of", "tissues", "rich", "in", "fibrillar", "collagen", "such", "as", "the", "skin", "and", "lungs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4274	[ "The", "regulation", "of", "collagenase", "expression", "is", "cell", "-", "type", "specific", ";", "bacterial", "LPS", "and", "zymosan", ",", "a", "yeast", "cell", "wall", "derivative", ",", "are", "potent", "inducers", "of", "collagenase", "expression", "in", "macrophages", ",", "but", "do", "not", "alter", "fibroblast", "collagenase", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]
4275	[ "Since", "promoter", "elements", "controlling", "collagenase", "transcription", "in", "monocytic", "cells", "have", "not", "been", "previously", "defined", ",", "we", "sought", "to", "delineate", "responsive", "cis", "-", "acting", "elements", "of", "the", "collagenase", "promoter", "in", "transiently", "transfected", "human", "(", "U937", ")", "and", "murine", "(", "J774", ")", "monocytic", "cell", "lines", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4276	[ "Deletion", "constructs", "containing", "as", "little", "as", "72", "bp", "of", "5", "'", "-", "flanking", "sequence", "of", "the", "collagenase", "promoter", "were", "sufficient", "for", "LPS", "-", "or", "zymosan", "-", "mediated", "transcriptional", "induction", ",", "whereas", "phorbol", "inducibility", "exhibited", "an", "absolute", "requirement", "for", "upstream", "elements", "including", "the", "polyoma", "enhancer", "A", "-", "binding", "protein", "-", "3", "site", "(", "-", "83", "to", "-", "91", ")", "and", "TTCA", "sequence", "(", "-", "102", "to", "-", "105", ")", "in", "both", "monocytic", "cells", "and", "fibroblasts", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4277	[ "Mutagenesis", "of", "the", "activator", "protein", "-", "1", "[", "AP", "-", "1", "]", "site", "at", "-", "72", "abolished", "basal", "promoter", "activity", "and", "LPS", "/", "zymosan", "inducibility", ",", "while", "mutagenesis", "of", "an", "NF", "-", "kappaB", "-", "like", "site", "at", "-", "20", "to", "-", "10", "had", "no", "effect", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4278	[ "Nuclear", "extracts", "from", "LPS", "-", "and", "zymosan", "-", "treated", "cells", "showed", "strong", "AP", "-", "1", "activity", "by", "gel", "-", "shift", "analysis", ",", "and", "supershift", "analysis", "showed", "the", "AP", "-", "1", "complexes", "contained", "specific", "members", "of", "both", "the", "jun", "and", "fos", "gene", "families", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]
4279	[ "Furthermore", ",", "as", "compared", "to", "regulation", "by", "phorbol", "ester", ",", "collagenase", "induction", "in", "monocytic", "cells", "by", "cell", "wall", "derivatives", "of", "bacteria", "or", "yeast", "is", "largely", "independent", "of", "upstream", "promoter", "sequences", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
4280	[ "Activation", "of", "c", "-", "Jun", "N", "-", "terminal", "kinase", "in", "bacterial", "lipopolysaccharide", "-", "stimulated", "macrophages", "." ]	[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4281	[ "Previous", "work", "has", "suggested", "that", "activation", "of", "the", "transcription", "factor", "activator", "protein", "1", "(", "AP", "-", "1", ")", "is", "one", "LPS", "-", "induced", "event", "that", "mediates", "this", "response", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4282	[ "Consistent", "with", "this", "notion", ",", "we", "found", "that", "LPS", "stimulated", "AP", "-", "1", "-", "mediated", "transcription", "of", "a", "transfected", "reporter", "gene", "in", "the", "murine", "macrophage", "cell", "line", "RAW", "264", ".", "7", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4283	[ "As", "AP", "-", "1", "activity", "is", "regulated", "in", "part", "by", "activation", "of", "the", "c", "-", "Jun", "N", "-", "terminal", "kinase", "(", "JNK", ")", ",", "which", "phosphorylates", "and", "subsequently", "increases", "the", "transcriptional", "activity", "of", "c", "-", "Jun", ",", "we", "examined", "whether", "LPS", "treatment", "of", "macrophages", "resulted", "in", "activation", "of", "this", "kinase", "." ]	[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]
4284	[ "Treatment", "with", "wild", "-", "type", "and", "rough", "mutant", "forms", "of", "LPS", "and", "synthetic", "lipid", "A", "resulted", "in", "JNK", "activation", ",", "while", "pretreatment", "with", "the", "tyrosine", "kinase", "inhibitor", "herbimycin", "A", "inhibited", "this", "response", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4285	[ "Binding", "of", "LPS", "-", "LPS", "binding", "protein", "(", "LBP", ")", "complexes", "to", "CD14", ",", "a", "surface", "receptor", "that", "mediates", "many", "LPS", "responses", ",", "was", "found", "to", "be", "crucial", ",", "as", "pretreatment", "of", "THP", "-", "1", "cells", "with", "the", "monoclonal", "antibody", "60b", ",", "which", "blocks", "this", "binding", ",", "inhibited", "JNK", "activation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]
4286	[ "Surfactant", "suppresses", "NF", "-", "kappa", "B", "activation", "in", "human", "monocytic", "cells", "." ]	[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4287	[ "In", "addition", "to", "biophysical", "properties", ",", "pulmonary", "surfactant", "has", "immunomodulatory", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4288	[ "We", "previously", "demonstrated", "that", "both", "synthetic", "(", "Exosurf", ")", "and", "modified", "natural", "surfactant", "(", "Survanta", ")", "downregulated", "endotoxin", "-", "stimulated", "inflammatory", "c", "ytokine", "mRNA", "levels", "and", "protein", "products", "(", "tumor", "necrosis", "factor", "-", "alpha", "[", "TNF", "]", ",", "interleukin", "-", "1", "-", "beta", "[", "IL", "-", "1", "]", ",", "interleukin", "-", "6", "[", "IL", "-", "6", "]", ")", "in", "human", "alveolar", "macrophages", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4289	[ "In", "this", "study", ",", "we", "report", "that", "both", "Exosurf", "and", "Survanta", "suppress", "TNF", "mRNA", "and", "secretion", "(", "85", "+", "/", "-", "4", "%", "mean", "percent", "inhibition", "+", "/", "-", "SEM", "by", "Exosurf", ";", "71", "+", "/", "-", "6", "%", "by", "Survanta", ")", "by", "endotoxin", "-", "stimulated", "THP", "-", "1", ",", "a", "human", "monocytic", "cell", "line", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4290	[ "Because", "surfactant", "downregulated", "inflammatory", "cytokine", "production", "similarly", "in", "both", "normal", "human", "alveolar", "macrophages", "and", "the", "THP", "-", "1", "cell", "line", ",", "we", "used", "this", "cell", "line", "to", "investigate", "whether", "surfactant", "affected", "transcriptional", "mechanisms", "." ]	[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4291	[ "Specifically", ",", "we", "examined", "nuclear", "factor", "-", "kappa", "B", "(", "NF", "-", "kappa", "B", ")", "activation", "because", "it", "is", "crucial", "in", "transcriptional", "regulation", "of", "many", "inflammatory", "cytokine", "genes", "including", "TNF", ",", "IL", "-", "1", ",", "and", "IL", "-", "6", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]
4292	[ "Electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "showed", "that", "both", "surfactants", "decreased", "activation", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]
4293	[ "The", "presence", "of", "both", "p65", "and", "p50", "NF", "-", "kappa", "B", "components", "in", "LPS", "-", "activated", "THP", "-", "1", "cells", "was", "confirmed", "by", "specific", "antibody", "induction", "of", "supershifts", "in", "mobility", "assays", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4294	[ "These", "results", "are", "the", "first", "to", "suggest", "that", "surfactant", "'", "s", "suppressive", "effects", "on", "inflammatory", "cytokine", "production", "may", "involve", "transcriptional", "regulation", "through", "inhibition", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "activation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O" ]
4295	[ "The", "costimulatory", "molecule", "B7", ".", "1", "provides", "a", "second", "signal", "critical", "for", "T", "cell", "activation", "." ]	[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4296	[ "The", "distribution", "of", "this", "integral", "membrane", "protein", "is", "restricted", "to", "certain", "tissues", "where", "its", "level", "of", "expression", "is", "modulated", "by", "multiple", "exogenous", "stimuli", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4297	[ "To", "identify", "the", "molecular", "basis", "for", "specificity", "and", "inducibility", ",", "the", "chromatin", "configuration", "of", "the", "human", "B7", ".", "1", "gene", "was", "examined", "in", "intact", "nuclei", "from", "various", "cell", "types", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
4298	[ "The", "identification", "of", "a", "tissue", "-", "specific", "deoxyribonuclease", "I", "hypersensitive", "site", "approximately", "3kb", "upstream", "of", "the", "transcription", "start", "site", "led", "to", "the", "characterization", "of", "a", "cell", "type", "-", "specific", "enhancer", "region", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]
4299	[ "In", "B7", ".", "1", "-", "positive", "B", "cells", ",", "this", "element", "bound", "several", "members", "of", "the", "NF", "-", "kappaB", "family", ",", "transcription", "factors", "already", "implicated", "in", "signal", "transduction", "pathways", "relevant", "to", "B7", ".", "1", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]
4300	[ "Ubiquitinylation", "of", "transcription", "factors", "c", "-", "Jun", "and", "c", "-", "Fos", "using", "reconstituted", "ubiquitinylating", "enzymes", "." ]	[ "O", "O", "B", "I", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O" ]

4201

[ "In", "Rel", "-", "/", "-", "splenic", "T", "cell", "cultures", "stimulated", "with", "phorbol", "12", "-", "myristate", "13", "-", "acetate", "and", "ionomycin", ",", "the", "levels", "of", "IL", "-", "3", ",", "IL", "-", "5", ",", "granulocyte", "-", "macrophage", "colony", "-", "stimulating", "factor", "(", "GM", "-", "CSF", ")", ",", "tumor", "necrosis", "factor", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", ",", "and", "gamma", "interferon", "(", "IFN", "-", "gamma", ")", "were", "only", "2", "-", "to", "3", "-", "fold", "lower", "compared", "with", "normal", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4202

[ "In", "contrast", ",", "anti", "-", "CD3", "and", "anti", "-", "CD28", "stimulated", "Rel", "-", "/", "-", "T", "cells", ",", "which", "fail", "to", "proliferate", ",", "make", "little", "or", "no", "detectable", "cytokines", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

4203

[ "In", "contrast", "to", "mitogen", "-", "activated", "Rel", "-", "/", "-", "T", "cells", ",", "lipopolysaccharide", "-", "stimulated", "Rel", "-", "/", "-", "macrophages", "produce", "higher", "than", "normal", "levels", "of", "GM", "-", "CSF", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

4204

[ "Activation", "of", "T", "lymphocytes", "requires", "the", "combined", "signaling", "of", "the", "T", "cell", "receptor", "and", "costimulatory", "molecules", "such", "as", "CD28", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "O" ]

4205

[ "The", "ability", "of", "T", "cells", "to", "produce", "interleukin", "-", "2", "(", "IL", "-", "2", ")", "is", "a", "critical", "control", "point", "in", "T", "lymphocyte", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4206

[ "The", "IL", "-", "2", "enhancer", "contains", "a", "functional", "motif", "named", "CD28", "response", "element", "(", "CD28RE", ")", "that", "serves", "a", "role", "as", "a", "target", "for", "mitogenic", "T", "cell", "activation", "signals", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4207

[ "The", "CD28RE", "sequence", "reveals", "similarity", "to", "the", "consensus", "kappaB", "binding", "motif", "." ]

[ "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

4208

[ "Here", "we", "demonstrate", "that", "CD28RE", "binds", "an", "inducible", "protein", "with", "a", "molecular", "mass", "of", "approximately", "35", "kDa", "called", "nuclear", "factor", "of", "mitogenic", "-", "activated", "T", "cells", "(", "NF", "-", "MATp35", ")", "that", "is", "clearly", "different", "from", "the", "known", "NF", "-", "kappaB", "/", "Rel", "family", "members", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

4209

[ "Induction", "of", "NF", "-", "MATp35", "was", "shown", "to", "depend", "on", "de", "novo", "protein", "synthesis", "and", "was", "restricted", "to", "T", "cells", "that", "received", "a", "mitogenic", "combination", "of", "T", "cell", "stimuli", ",", "not", "necessarily", "including", "CD28", "signaling", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]

4210

[ "Nonmitogenic", "T", "cell", "stimulation", "did", "not", "result", "in", "appearance", "of", "NF", "-", "MATp35", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

4211

[ "Similar", "to", "its", "effect", "on", "IL", "-", "2", "production", ",", "cyclosporin", "A", "inhibited", "the", "induction", "of", "NF", "-", "MATp35", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

4212

[ "Taken", "together", ",", "these", "data", "demonstrate", "that", "the", "nuclear", "appearance", "of", "NF", "-", "MATp35", "shows", "excellent", "correlation", "with", "IL", "-", "2", "production", ",", "which", "is", "a", "unique", "characteristic", "among", "nuclear", "factors", "implicated", "in", "the", "control", "of", "IL", "-", "2", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O" ]

4213

[ "The", "work", "reported", "here", "resolves", ",", "at", "the", "level", "of", "gene", "regulation", ",", "the", "controversy", "as", "to", "whether", "or", "not", "human", "monocytes", "/", "macrophages", "can", "produce", "nitric", "oxide", "(", "NO", ")", "when", "stimulated", "with", "lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", ",", "with", "or", "without", "co", "-", "stimulation", "by", "interferon", "-", "gamma", "(", "IFN", "-", "gamma", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

4214

[ "Studies", "included", "structural", "comparison", "of", "the", "promoters", "for", "human", "and", "mouse", "inducible", "NO", "synthase", "(", "iNOS", ")", "genes", ",", "transfection", "and", "assay", "of", "human", "and", "mouse", "iNOS", "promoter", "regions", "in", "response", "to", "LPS", "+", "/", "-", "IFN", "-", "gamma", ",", "and", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "of", "kappa", "B", "response", "elements", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

4215

[ "The", "importance", "of", "resolution", "of", "this", "controversy", "is", "that", "future", "research", "in", "this", "area", "should", "be", "directed", "toward", "the", "understanding", "of", "alternative", "mechanisms", "that", "can", "result", "in", "the", "successful", "production", "of", "NO", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4216

[ "X", "inactivation", "analysis", "in", "a", "female", "with", "hypomelanosis", "of", "Ito", "associated", "with", "a", "balanced", "X", ";", "17", "translocation", ":", "evidence", "for", "functional", "disomy", "of", "Xp", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4217

[ "X", "inactivation", "analysis", "was", "performed", "on", "normal", "and", "hypopigmented", "skin", "samples", "obtained", "from", "a", "female", "with", "hypomelanosis", "of", "Ito", "associated", "with", "a", "balanced", "whole", "arm", "X", ";", "17", "translocation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

4218

[ "In", "addition", ",", "dual", "colour", "FISH", "analysis", "using", "centromere", "specific", "probes", "for", "chromosomes", "X", "and", "17", "showed", "that", "the", "breakpoints", "on", "both", "chromosomes", "lie", "within", "the", "alphoid", "arrays", ",", "making", "interruption", "of", "a", "locus", "on", "either", "chromosome", "unlikely", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4219

[ "Identification", "of", "a", "herpesvirus", "Saimiri", "cis", "-", "acting", "DNA", "fragment", "that", "permits", "stable", "replication", "of", "episomes", "in", "transformed", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4220

[ "Herpesvirus", "saimiri", "is", "a", "lymphotropic", "herpesvirus", "capable", "of", "immortalizing", "and", "transforming", "T", "cells", "both", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4221

[ "Immortalized", "and", "transformed", "T", "cells", "harbor", "several", "copies", "of", "the", "viral", "genome", "as", "a", "persisting", "genome", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "O" ]

4222

[ "The", "mapping", "of", "the", "cis", "-", "acting", "genetic", "cis", "-", "acting", "segment", "(", "oriP", ")", "required", "for", "viral", "episomal", "maintenance", "is", "reported", "here", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4223

[ "Viral", "DNA", "fragments", "that", "potentially", "contain", "oriP", "were", "cloned", "into", "a", "plasmid", "that", "contains", "the", "hygromycin", "resistance", "gene", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

4224

[ "This", "viral", "fragment", "permits", "stable", "plasmid", "replication", "without", "deletion", "or", "rearrangement", "as", "well", "as", "episomal", "maintenance", "without", "integration", "or", "recombination", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4225

[ "The", "function", "of", "oriP", "depends", "on", "a", "trans", "-", "acting", "factor", "(", "s", ")", "encoded", "by", "the", "viral", "genome", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

4226

[ "The", "1", ".", "955", "-", "kb", "viral", "segment", "includes", "a", "dyad", "symmetry", "region", "located", "between", "two", "small", "nuclear", "RNA", "genes", "and", "is", "located", "upstream", "of", "the", "dihydrofolate", "reductase", "gene", "homolog", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

4227

[ "Therefore", ",", "this", "oriP", "contains", "novel", "elements", "distinct", "from", "those", "of", "other", "DNA", "viruses", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4228

[ "In", "vivo", "anergized", "CD4", "+", "T", "cells", "express", "perturbed", "AP", "-", "1", "and", "NF", "-", "kappa", "B", "transcription", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "B", "I", "O" ]

4229

[ "Anergy", "is", "a", "major", "mechanism", "to", "ensure", "antigen", "-", "specific", "tolerance", "in", "T", "lymphocytes", "in", "the", "adult", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4230

[ "In", "vivo", ",", "anergy", "has", "mainly", "been", "studied", "at", "the", "cellular", "level", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4231

[ "In", "this", "study", ",", "we", "used", "the", "T", "-", "cell", "-", "activating", "superantigen", "staphylococcal", "enterotoxin", "A", "(", "SEA", ")", "to", "investigate", "molecular", "mechanisms", "of", "T", "-", "lymphocyte", "anergy", "in", "vivo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4232

[ "Injection", "of", "SEA", "to", "adult", "mice", "activates", "CD4", "+", "T", "cells", "expressing", "certain", "T", "-", "cell", "receptor", "(", "TCR", ")", "variable", "region", "beta", "-", "chain", "families", "and", "induces", "strong", "and", "rapid", "production", "of", "interleukin", "2", "(", "IL", "-", "2", ")", "." ]

[ "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

4233

[ "In", "contrast", ",", "repeated", "injections", "of", "SEA", "cause", "CD4", "+", "T", "-", "cell", "deletion", "and", "anergy", "in", "the", "remaining", "CD4", "+", "T", "cells", ",", "characterized", "by", "reduced", "expression", "of", "IL", "-", "2", "at", "mRNA", "and", "protein", "levels", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4234

[ "We", "analyzed", "expression", "of", "AP", "-", "1", ",", "NF", "-", "kappa", "B", ",", "NF", "-", "AT", ",", "and", "octamer", "binding", "transcription", "factors", ",", "which", "are", "known", "to", "be", "involved", "in", "the", "regulation", "of", "IL", "-", "2", "gene", "promoter", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

4235

[ "In", "contrast", ",", "anergic", "CD4", "+", "T", "cells", "contained", "severely", "reduced", "levels", "of", "AP", "-", "1", "and", "Fos", "/", "Jun", "-", "containing", "NF", "-", "AT", "complexes", "but", "expressed", "significant", "amounts", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "and", "Oct", "binding", "proteins", "after", "SEA", "stimulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O" ]

4236

[ "Resolution", "of", "the", "NF", "-", "kappa", "B", "complex", "demonstrated", "predominant", "expression", "of", "p50", "-", "p65", "heterodimers", "in", "activated", "CD4", "+", "T", "cells", ",", "while", "anergic", "cells", "mainly", "expressed", "the", "transcriptionally", "inactive", "p50", "homodimer", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

4237

[ "These", "alterations", "of", "transcription", "factors", "are", "likely", "to", "be", "responsible", "for", "repression", "of", "IL", "-", "2", "in", "anergic", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4238

[ "Stimulation", "through", "the", "Fas", "/", "APO", "-", "1", "receptor", "results", "in", "apoptosis", "through", "an", "incompletely", "characterized", "signaling", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4239

[ "It", "has", "been", "shown", "that", "TCR", "stimulation", "requires", "both", "the", "membrane", "tyrosine", "phosphatase", ",", "CD45", ",", "and", "the", "Src", "-", "family", "kinase", ",", "Lck", ",", "to", "result", "in", "cellular", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4240

[ "Further", ",", "in", "normal", "and", "CD45", "-", "or", "Lck", "-", "deficient", "cell", "lines", ",", "Fas", "stimulation", "results", "in", "activation", "of", "Jun", "kinase", "(", "JNK", ")", ",", "a", "proposed", "mediator", "of", "stress", "activation", "pathways", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4241

[ "Previous", "studies", "have", "also", "demonstrated", "a", "role", "for", "endogenous", "ceramide", "release", "in", "Fas", "-", "mediated", "apoptosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4242

[ "We", "show", "that", "stimulation", "with", "a", "synthetic", "ceramide", "analog", "results", "in", "JNK", "activation", "as", "well", "as", "apoptosis", ",", "suggesting", "ceramide", "release", "occurs", "proximal", "to", "JNK", "activation", "in", "Fas", "signaling", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "O", "O" ]

4243

[ "Our", "data", "suggest", "that", "although", "CD45", "and", "Lck", "are", "not", "required", "for", "Fas", "signaling", ",", "JNK", "activation", "may", "play", "an", "important", "role", "transducing", "distal", "signals", "that", "lead", "to", "apoptosis", "after", "Fas", "ligation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]

4244

[ "In", "vivo", "protein", "-", "DNA", "interactions", "of", "the", "human", "beta", "-", "globin", "locus", "in", "erythroid", "cells", "expressing", "the", "fetal", "or", "the", "adult", "globin", "gene", "program", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O" ]

4245

[ "To", "characterize", "the", "protein", "-", "DNA", "interactions", "important", "for", "the", "developmental", "control", "of", "the", "human", "beta", "-", "globin", "locus", ",", "we", "analyzed", "by", "in", "vivo", "dimethyl", "sulfate", "footprinting", "erythroid", "cells", "expressing", "either", "the", "fetal", "or", "the", "adult", "globin", "developmental", "program", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4246

[ "In", "the", "locus", "control", "region", "(", "LCR", ")", "of", "the", "beta", "-", "globin", "locus", ",", "in", "vivo", "footprints", "on", "NF", "-", "E2", "(", "or", "AP", "-", "1", ")", "and", "GATA", "-", "1", "motifs", "remained", "the", "same", "regardless", "of", "whether", "the", "fetal", "or", "the", "adult", "globin", "genes", "are", "expressed", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O" ]

4247

[ "In", "promoter", "regions", ",", "the", "actively", "transcribed", "genes", "demonstrated", "extensive", "and", "consistent", "footprints", "over", "the", "canonical", "elements", ",", "such", "as", "CACCC", "and", "CCAAT", "motifs", "." ]

[ "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

4248

[ "The", "adult", "globin", "expressing", "cells", "displayed", "more", "extensive", "footprints", "than", "the", "fetal", "globin", "expressing", "cells", "in", "the", "3", "'", "regulatory", "sequences", "of", "both", "the", "Agamma", "-", "and", "the", "beta", "-", "globin", "genes", ",", "suggesting", "a", "role", "of", "these", "3", "'", "elements", "in", "beta", "-", "globin", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O" ]

4249

[ "Our", "results", "suggest", "that", "the", "bulk", "of", "protein", "-", "DNA", "interactions", "that", "underlies", "the", "developmental", "control", "of", "globin", "genes", "takes", "place", "in", "the", "gamma", "-", "and", "beta", "-", "globin", "gene", "promoters", ",", "and", "that", "GT", "motifs", "of", "the", "beta", "-", "globin", "locus", "LCR", "may", "play", "a", "role", "in", "the", "developmental", "regulation", "of", "human", "beta", "-", "globin", "gene", "expression", ",", "perhaps", "by", "increasing", "the", "probability", "of", "interaction", "of", "the", "LCR", "holocomplex", "with", "the", "fetal", "or", "the", "adult", "globin", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

4250

[ "Antisense", "inhibition", "of", "vitamin", "D", "receptor", "expression", "induces", "apoptosis", "in", "monoblastoid", "U937", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4251

[ "These", "effects", "are", "controlled", "by", "the", "vitamin", "D", "receptor", "(", "VDR", ")", ",", "a", "member", "of", "the", "steroid", "hormone", "receptor", "family", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

4252

[ "The", "objective", "of", "this", "study", "was", "to", "develop", "U937", "transfectants", "expressing", "antisense", "VDR", "mRNA", ",", "and", "to", "use", "these", "to", "examine", "the", "role", "of", "1", ",", "25", "(", "OH", ")", "2D3", "-", "VDR", "interaction", "in", "this", "lineage", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4253

[ "A", "2", "-", "kb", "VDR", "cDNA", "insert", "(", "including", "the", "complete", "VDR", "coding", "region", ")", "was", "cloned", "in", "an", "antisense", "orientation", "into", "the", "EBV", "episomal", "vector", "pMEP4", "under", "the", "control", "of", "an", "inducible", "promoter", "and", "transfected", "into", "U937", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4254

[ "The", "resultant", "cell", "line", ",", "DH42", ",", "was", "hygromycin", "resistant", ",", "contained", "VDR", "cDNA", ",", "expressed", "fewer", "VDRs", "than", "controls", ",", "and", "showed", "a", "substantial", "decrease", "in", "antiproliferative", "response", "to", "1", ",", "25", "(", "OH", ")", "2D3", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4255

[ "However", ",", "1", ",", "25", "(", "OH", ")", "2D3", "increased", "the", "number", "of", "cells", "expressing", "macrophage", "cell", "surface", "Ags", ",", "including", "CD14", "and", "CD11b", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "O", "B", "O" ]

4256

[ "A", "subpopulation", "of", "smaller", "cells", "did", "not", "express", "the", "differentiation", "markers", "after", "cadmium", "stimulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4257

[ "A", "considerable", "proportion", "of", "cells", "were", "outside", "the", "cycle", "and", "DNA", "fragmentation", "confirmed", "apoptosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4258

[ "Thus", ",", "the", "functional", "outcome", "of", "the", "VDR", "antisense", "transfection", "suggests", "that", "in", "the", "myelomonocytic", "lineage", ",", "VDR", "expression", "may", "act", "as", "a", "protective", "mechanism", "against", "programmed", "cell", "death", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4259

[ "Human", "T", "lymphotropic", "virus", "-", "I", "infection", "of", "human", "T", "lymphocytes", "induces", "expression", "of", "the", "beta", "-", "galactoside", "-", "binding", "lectin", ",", "galectin", "-", "3", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O" ]

4260

[ "Animal", "lectins", "play", "important", "roles", "in", "a", "variety", "of", "biological", "processes", "via", "their", "recognition", "of", "glycoconjugates", "." ]

[ "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4261

[ "Galectin", "-", "3", "is", "a", "beta", "-", "galactoside", "-", "binding", "lectin", "previously", "designated", "as", "epsilon", "BP", "(", "IgE", "-", "binding", "protein", ")", ",", "CBP35", ",", "Mac", "-", "2", ",", "L", "-", "29", ",", "and", "L", "-", "34", ",", "and", "its", "expression", "has", "been", "associated", "with", "various", "physiological", "and", "pathological", "processes", ",", "including", "cell", "growth", ",", "tumor", "transformation", ",", "and", "metastasis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4262

[ "Galectin", "-", "3", "is", "widely", "distributed", "in", "various", "tissues", "and", "cell", "types", "and", "is", "expressed", "in", "many", "leukocytes", ",", "with", "the", "notable", "exception", "of", "B", "and", "T", "lymphocytes", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4263

[ "We", "now", "report", "that", "galectin", "-", "3", "is", "abundantly", "expressed", "in", "a", "number", "of", "human", "T", "lymphotropic", "virus", "(", "HTLV", ")", "-", "I", "-", "infected", "human", "T", "cell", "lines", ",", "including", "F6T", ",", "HUT", "102", ",", "K3T", ",", "MT", "-", "2", ",", "and", "SLB", "-", "I", ",", "but", "is", "not", "expressed", "in", "non", "-", "HTLV", "-", "I", "-", "infected", "T", "cell", "lines", "such", "as", "Jurkat", ",", "CEM", ",", "and", "MOLT", "-", "4", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4264

[ "In", "addition", ",", "the", "galectin", "-", "3", "level", "was", "markedly", "increased", "in", "human", "thymocytes", "after", "infection", "with", "HTLV", "-", "I", "as", "compared", "with", "uninfected", "thymocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4265

[ "The", "up", "-", "regulation", "of", "galectin", "-", "3", "expression", "appeared", "to", "correlate", "well", "with", "HTLV", "-", "I", "gene", "expression", ",", "as", "undetectable", "or", "very", "low", "levels", "of", "galectin", "-", "3", "were", "found", "in", "the", "S1T", "and", "ATL", "-", "1K", "cell", "lines", ",", "which", "are", "nonproductively", "infected", "with", "HTLV", "-", "I", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4266

[ "In", "co", "-", "transfection", "experiments", ",", "the", "galectin", "-", "3", "promoter", "was", "significantly", "up", "-", "regulated", "by", "expression", "vectors", "encoding", "the", "40", "-", "kd", "Tax", "protein", ",", "a", "potent", "transactivator", "in", "HTLV", "-", "I", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4267

[ "Analysis", "of", "various", "Tax", "mutants", "suggested", "that", "galectin", "-", "3", "promoter", "induction", "is", "dependent", "on", "activation", "of", "the", "cyclic", "-", "AMP", "-", "responsive", "element", "binding", "protein", "/", "activation", "transcription", "factor", "family", "of", "transcription", "factors", "and", ",", "to", "a", "lesser", "extent", ",", "nuclear", "factor", "-", "kappa", "B", "/", "Rel", "induction", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O" ]

4268

[ "Transfection", "of", "human", "promonocytic", "U", "-", "937", "cells", "with", "an", "HTLV", "-", "I", "Tax", "expression", "vector", "induced", "galectin", "-", "3", "expression", "in", "this", "cell", "line", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4269

[ "Functionally", ",", "galectin", "-", "3", "was", "shown", "to", "activate", "interleukin", "-", "2", "production", "in", "Jurkat", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4270

[ "Together", ",", "these", "findings", "raise", "the", "possibility", "that", "HTLV", "-", "I", "Tax", "production", "induces", "the", "transcription", "and", "subsequent", "synthesis", "and", "secretion", "of", "galectin", "-", "3", ",", "which", "in", "turn", "may", "further", "activate", "these", "T", "cells", "and", "contribute", "to", "the", "altered", "properties", "of", "cell", "growth", "found", "in", "adult", "T", "cell", "leukemia", "induced", "by", "HTLV", "-", "I", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4271

[ "Monocytic", "cell", "type", "-", "specific", "transcriptional", "induction", "of", "collagenase", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

4272

[ "Interstitial", "collagenase", "(", "MMP", "-", "1", ")", ",", "a", "metalloproteinase", "produced", "by", "resident", "and", "inflammatory", "cells", "during", "connective", "tissue", "turnover", ",", "cleaves", "type", "I", "collagen", "fibrils", "." ]

[ "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

4273

[ "This", "catalytic", "event", "is", "rate", "limiting", "in", "remodeling", "of", "tissues", "rich", "in", "fibrillar", "collagen", "such", "as", "the", "skin", "and", "lungs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4274

[ "The", "regulation", "of", "collagenase", "expression", "is", "cell", "-", "type", "specific", ";", "bacterial", "LPS", "and", "zymosan", ",", "a", "yeast", "cell", "wall", "derivative", ",", "are", "potent", "inducers", "of", "collagenase", "expression", "in", "macrophages", ",", "but", "do", "not", "alter", "fibroblast", "collagenase", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]

4275

[ "Since", "promoter", "elements", "controlling", "collagenase", "transcription", "in", "monocytic", "cells", "have", "not", "been", "previously", "defined", ",", "we", "sought", "to", "delineate", "responsive", "cis", "-", "acting", "elements", "of", "the", "collagenase", "promoter", "in", "transiently", "transfected", "human", "(", "U937", ")", "and", "murine", "(", "J774", ")", "monocytic", "cell", "lines", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4276

[ "Deletion", "constructs", "containing", "as", "little", "as", "72", "bp", "of", "5", "'", "-", "flanking", "sequence", "of", "the", "collagenase", "promoter", "were", "sufficient", "for", "LPS", "-", "or", "zymosan", "-", "mediated", "transcriptional", "induction", ",", "whereas", "phorbol", "inducibility", "exhibited", "an", "absolute", "requirement", "for", "upstream", "elements", "including", "the", "polyoma", "enhancer", "A", "-", "binding", "protein", "-", "3", "site", "(", "-", "83", "to", "-", "91", ")", "and", "TTCA", "sequence", "(", "-", "102", "to", "-", "105", ")", "in", "both", "monocytic", "cells", "and", "fibroblasts", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4277

[ "Mutagenesis", "of", "the", "activator", "protein", "-", "1", "[", "AP", "-", "1", "]", "site", "at", "-", "72", "abolished", "basal", "promoter", "activity", "and", "LPS", "/", "zymosan", "inducibility", ",", "while", "mutagenesis", "of", "an", "NF", "-", "kappaB", "-", "like", "site", "at", "-", "20", "to", "-", "10", "had", "no", "effect", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4278

[ "Nuclear", "extracts", "from", "LPS", "-", "and", "zymosan", "-", "treated", "cells", "showed", "strong", "AP", "-", "1", "activity", "by", "gel", "-", "shift", "analysis", ",", "and", "supershift", "analysis", "showed", "the", "AP", "-", "1", "complexes", "contained", "specific", "members", "of", "both", "the", "jun", "and", "fos", "gene", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]

4279

[ "Furthermore", ",", "as", "compared", "to", "regulation", "by", "phorbol", "ester", ",", "collagenase", "induction", "in", "monocytic", "cells", "by", "cell", "wall", "derivatives", "of", "bacteria", "or", "yeast", "is", "largely", "independent", "of", "upstream", "promoter", "sequences", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

4280

[ "Activation", "of", "c", "-", "Jun", "N", "-", "terminal", "kinase", "in", "bacterial", "lipopolysaccharide", "-", "stimulated", "macrophages", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4281

[ "Previous", "work", "has", "suggested", "that", "activation", "of", "the", "transcription", "factor", "activator", "protein", "1", "(", "AP", "-", "1", ")", "is", "one", "LPS", "-", "induced", "event", "that", "mediates", "this", "response", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4282

[ "Consistent", "with", "this", "notion", ",", "we", "found", "that", "LPS", "stimulated", "AP", "-", "1", "-", "mediated", "transcription", "of", "a", "transfected", "reporter", "gene", "in", "the", "murine", "macrophage", "cell", "line", "RAW", "264", ".", "7", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4283

[ "As", "AP", "-", "1", "activity", "is", "regulated", "in", "part", "by", "activation", "of", "the", "c", "-", "Jun", "N", "-", "terminal", "kinase", "(", "JNK", ")", ",", "which", "phosphorylates", "and", "subsequently", "increases", "the", "transcriptional", "activity", "of", "c", "-", "Jun", ",", "we", "examined", "whether", "LPS", "treatment", "of", "macrophages", "resulted", "in", "activation", "of", "this", "kinase", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

4284

[ "Treatment", "with", "wild", "-", "type", "and", "rough", "mutant", "forms", "of", "LPS", "and", "synthetic", "lipid", "A", "resulted", "in", "JNK", "activation", ",", "while", "pretreatment", "with", "the", "tyrosine", "kinase", "inhibitor", "herbimycin", "A", "inhibited", "this", "response", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4285

[ "Binding", "of", "LPS", "-", "LPS", "binding", "protein", "(", "LBP", ")", "complexes", "to", "CD14", ",", "a", "surface", "receptor", "that", "mediates", "many", "LPS", "responses", ",", "was", "found", "to", "be", "crucial", ",", "as", "pretreatment", "of", "THP", "-", "1", "cells", "with", "the", "monoclonal", "antibody", "60b", ",", "which", "blocks", "this", "binding", ",", "inhibited", "JNK", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]

4286

[ "Surfactant", "suppresses", "NF", "-", "kappa", "B", "activation", "in", "human", "monocytic", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4287

[ "In", "addition", "to", "biophysical", "properties", ",", "pulmonary", "surfactant", "has", "immunomodulatory", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4288

[ "We", "previously", "demonstrated", "that", "both", "synthetic", "(", "Exosurf", ")", "and", "modified", "natural", "surfactant", "(", "Survanta", ")", "downregulated", "endotoxin", "-", "stimulated", "inflammatory", "c", "ytokine", "mRNA", "levels", "and", "protein", "products", "(", "tumor", "necrosis", "factor", "-", "alpha", "[", "TNF", "]", ",", "interleukin", "-", "1", "-", "beta", "[", "IL", "-", "1", "]", ",", "interleukin", "-", "6", "[", "IL", "-", "6", "]", ")", "in", "human", "alveolar", "macrophages", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4289

[ "In", "this", "study", ",", "we", "report", "that", "both", "Exosurf", "and", "Survanta", "suppress", "TNF", "mRNA", "and", "secretion", "(", "85", "+", "/", "-", "4", "%", "mean", "percent", "inhibition", "+", "/", "-", "SEM", "by", "Exosurf", ";", "71", "+", "/", "-", "6", "%", "by", "Survanta", ")", "by", "endotoxin", "-", "stimulated", "THP", "-", "1", ",", "a", "human", "monocytic", "cell", "line", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4290

[ "Because", "surfactant", "downregulated", "inflammatory", "cytokine", "production", "similarly", "in", "both", "normal", "human", "alveolar", "macrophages", "and", "the", "THP", "-", "1", "cell", "line", ",", "we", "used", "this", "cell", "line", "to", "investigate", "whether", "surfactant", "affected", "transcriptional", "mechanisms", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4291

[ "Specifically", ",", "we", "examined", "nuclear", "factor", "-", "kappa", "B", "(", "NF", "-", "kappa", "B", ")", "activation", "because", "it", "is", "crucial", "in", "transcriptional", "regulation", "of", "many", "inflammatory", "cytokine", "genes", "including", "TNF", ",", "IL", "-", "1", ",", "and", "IL", "-", "6", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

4292

[ "Electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "showed", "that", "both", "surfactants", "decreased", "activation", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

4293

[ "The", "presence", "of", "both", "p65", "and", "p50", "NF", "-", "kappa", "B", "components", "in", "LPS", "-", "activated", "THP", "-", "1", "cells", "was", "confirmed", "by", "specific", "antibody", "induction", "of", "supershifts", "in", "mobility", "assays", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4294

[ "These", "results", "are", "the", "first", "to", "suggest", "that", "surfactant", "'", "s", "suppressive", "effects", "on", "inflammatory", "cytokine", "production", "may", "involve", "transcriptional", "regulation", "through", "inhibition", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O" ]

4295

[ "The", "costimulatory", "molecule", "B7", ".", "1", "provides", "a", "second", "signal", "critical", "for", "T", "cell", "activation", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4296

[ "The", "distribution", "of", "this", "integral", "membrane", "protein", "is", "restricted", "to", "certain", "tissues", "where", "its", "level", "of", "expression", "is", "modulated", "by", "multiple", "exogenous", "stimuli", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4297

[ "To", "identify", "the", "molecular", "basis", "for", "specificity", "and", "inducibility", ",", "the", "chromatin", "configuration", "of", "the", "human", "B7", ".", "1", "gene", "was", "examined", "in", "intact", "nuclei", "from", "various", "cell", "types", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

4298

[ "The", "identification", "of", "a", "tissue", "-", "specific", "deoxyribonuclease", "I", "hypersensitive", "site", "approximately", "3kb", "upstream", "of", "the", "transcription", "start", "site", "led", "to", "the", "characterization", "of", "a", "cell", "type", "-", "specific", "enhancer", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

4299

[ "In", "B7", ".", "1", "-", "positive", "B", "cells", ",", "this", "element", "bound", "several", "members", "of", "the", "NF", "-", "kappaB", "family", ",", "transcription", "factors", "already", "implicated", "in", "signal", "transduction", "pathways", "relevant", "to", "B7", ".", "1", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

4300

[ "Ubiquitinylation", "of", "transcription", "factors", "c", "-", "Jun", "and", "c", "-", "Fos", "using", "reconstituted", "ubiquitinylating", "enzymes", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O" ]