id
stringlengths 1
5
| tokens
list | ner_tags
list |
|---|---|---|
4601
|
[
"Furthermore",
",",
"recruitment",
"of",
"EKLF",
"to",
"5",
"'",
"HS3",
"only",
"occurred",
"in",
"beta",
"-",
"globin",
"-",
"expressing",
"murine",
"erythroid",
"leukemia",
"cells",
",",
"whereas",
"recruitment",
"of",
"EKLF",
"to",
"5",
"'",
"HS2",
"occurred",
"in",
"both",
"gamma",
"-",
"globin",
"-",
"expressing",
"K562",
"cells",
"and",
"murine",
"erythroid",
"leukemia",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4602
|
[
"Unlike",
"EKLF",
",",
"Sp1",
",",
"which",
"also",
"binds",
"to",
"CACCC",
"boxes",
",",
"is",
"not",
"recruited",
"to",
"5",
"'",
"HS3",
"."
] |
[
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
4603
|
[
"We",
"have",
"also",
"examined",
"how",
"one",
"5",
"'",
"HS",
"affects",
"the",
"recruitment",
"of",
"EKLF",
"to",
"another",
"5",
"'",
"HS",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
4604
|
[
"Estrogen",
"decreases",
"TNF",
"gene",
"expression",
"by",
"blocking",
"JNK",
"activity",
"and",
"the",
"resulting",
"production",
"of",
"c",
"-",
"Jun",
"and",
"JunD",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O"
] |
4605
|
[
"Central",
"to",
"the",
"bone",
"-",
"sparing",
"effect",
"of",
"estrogen",
"(",
"E",
"(",
"2",
")",
")",
"is",
"its",
"ability",
"to",
"block",
"the",
"monocytic",
"production",
"of",
"the",
"osteoclastogenic",
"cytokine",
"TNF",
"-",
"alpha",
"(",
"TNF",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O"
] |
4606
|
[
"However",
",",
"the",
"mechanism",
"by",
"which",
"E",
"(",
"2",
")",
"downregulates",
"TNF",
"production",
"is",
"presently",
"unknown",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4607
|
[
"Transient",
"transfection",
"studies",
"in",
"HeLa",
"cells",
",",
"an",
"E",
"(",
"2",
")",
"receptor",
"-",
"negative",
"line",
",",
"suggest",
"that",
"E",
"(",
"2",
")",
"inhibits",
"TNF",
"gene",
"expression",
"through",
"an",
"effect",
"mediated",
"by",
"estrogen",
"receptor",
"beta",
"(",
"ERbeta",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O"
] |
4608
|
[
"The",
"consequent",
"decrease",
"in",
"the",
"nuclear",
"levels",
"of",
"c",
"-",
"Jun",
"and",
"JunD",
"leads",
"to",
"diminished",
"binding",
"of",
"c",
"-",
"Jun",
"/",
"c",
"-",
"Fos",
"and",
"JunD",
"/",
"c",
"-",
"Fos",
"heterodimers",
"to",
"the",
"AP",
"-",
"1",
"consensus",
"sequence",
"in",
"the",
"TNF",
"promoter",
"and",
",",
"thus",
",",
"to",
"decreased",
"transactivation",
"of",
"the",
"TNF",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
4609
|
[
"Cutting",
"edge",
":",
"TCR",
"stimulation",
"by",
"antibody",
"and",
"bacterial",
"superantigen",
"induces",
"Stat3",
"activation",
"in",
"human",
"T",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4610
|
[
"Here",
",",
"we",
"show",
"that",
"CD3",
"ligation",
"by",
"mAb",
"and",
"Staphylococcal",
"enterotoxin",
"(",
"SE",
")",
"induce",
"a",
"rapid",
",",
"gradually",
"accumulating",
",",
"long",
"-",
"lasting",
"tyrosine",
",",
"and",
"serine",
"phosphorylation",
"of",
"Stat3",
"(",
"but",
"not",
"Stat5",
")",
"in",
"allogen",
"-",
"specific",
"human",
"CD4",
"+",
"T",
"cell",
"lines",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4611
|
[
"In",
"contrast",
",",
"IL",
"-",
"2",
"induces",
"a",
"rapid",
"and",
"transient",
"tyrosine",
"and",
"serine",
"phosphorylation",
"of",
"Stat3",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
4612
|
[
"Compared",
"with",
"IL",
"-",
"2",
",",
"CD3",
"ligation",
"induces",
"a",
"delayed",
"Stat3",
"binding",
"to",
"oligonucleotide",
"probes",
"from",
"the",
"ICAM",
"-",
"1",
"and",
"IL",
"-",
"2R",
"alpha",
"promoter",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
4613
|
[
"CD3",
"-",
"mediated",
"activation",
"of",
"Stat3",
"is",
"almost",
"completely",
"inhibited",
"by",
"a",
"Src",
"kinase",
"inhibitor",
"(",
"PP1",
")",
",",
"whereas",
"IL",
"-",
"2",
"-",
"induced",
"Stat3",
"activation",
"is",
"unaffected",
"."
] |
[
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4614
|
[
"Moreover",
",",
"we",
"provide",
"evidence",
"that",
"TCR",
"/",
"CD3",
"and",
"IL",
"-",
"2",
"induce",
"Stat3",
"activation",
"via",
"distinct",
"signaling",
"pathways",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4615
|
[
"Distinctive",
"gene",
"expression",
"patterns",
"in",
"human",
"mammary",
"epithelial",
"cells",
"and",
"breast",
"cancers",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4616
|
[
"cDNA",
"microarrays",
"and",
"a",
"clustering",
"algorithm",
"were",
"used",
"to",
"identify",
"patterns",
"of",
"gene",
"expression",
"in",
"human",
"mammary",
"epithelial",
"cells",
"growing",
"in",
"culture",
"and",
"in",
"primary",
"human",
"breast",
"tumors",
"."
] |
[
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4617
|
[
"Clusters",
"of",
"coexpressed",
"genes",
"identified",
"through",
"manipulations",
"of",
"mammary",
"epithelial",
"cells",
"in",
"vitro",
"also",
"showed",
"consistent",
"patterns",
"of",
"variation",
"in",
"expression",
"among",
"breast",
"tumor",
"samples",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4618
|
[
"By",
"using",
"immunohistochemistry",
"with",
"antibodies",
"against",
"proteins",
"encoded",
"by",
"a",
"particular",
"gene",
"in",
"a",
"cluster",
",",
"the",
"identity",
"of",
"the",
"cell",
"type",
"within",
"the",
"tumor",
"specimen",
"that",
"contributed",
"the",
"observed",
"gene",
"expression",
"pattern",
"could",
"be",
"determined",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4619
|
[
"Clusters",
"of",
"genes",
"with",
"coherent",
"expression",
"patterns",
"in",
"cultured",
"cells",
"and",
"in",
"the",
"breast",
"tumors",
"samples",
"could",
"be",
"related",
"to",
"specific",
"features",
"of",
"biological",
"variation",
"among",
"the",
"samples",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4620
|
[
"Two",
"such",
"clusters",
"were",
"found",
"to",
"have",
"patterns",
"that",
"correlated",
"with",
"variation",
"in",
"cell",
"proliferation",
"rates",
"and",
"with",
"activation",
"of",
"the",
"IFN",
"-",
"regulated",
"signal",
"transduction",
"pathway",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4621
|
[
"These",
"results",
"support",
"the",
"feasibility",
"and",
"usefulness",
"of",
"this",
"systematic",
"approach",
"to",
"studying",
"variation",
"in",
"gene",
"expression",
"patterns",
"in",
"human",
"cancers",
"as",
"a",
"means",
"to",
"dissect",
"and",
"classify",
"solid",
"tumors",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4622
|
[
"PPARgamma",
"activation",
"induces",
"the",
"expression",
"of",
"the",
"adipocyte",
"fatty",
"acid",
"binding",
"protein",
"gene",
"in",
"human",
"monocytes",
"."
] |
[
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4623
|
[
"The",
"peroxisome",
"-",
"proliferator",
"activated",
"receptor",
"gamma",
"(",
"PPARgamma",
")",
",",
"a",
"member",
"of",
"the",
"nuclear",
"receptor",
"superfamily",
"of",
"ligand",
"activated",
"transcription",
"factors",
",",
"plays",
"a",
"key",
"role",
"in",
"the",
"anti",
"-",
"diabetic",
"actions",
"of",
"the",
"thiazolidinediones",
"(",
"TZDs",
")",
"."
] |
[
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4624
|
[
"PPARgamma",
"induces",
"the",
"expression",
"of",
"many",
"genes",
"involved",
"in",
"lipid",
"anabolism",
",",
"including",
"the",
"adipocyte",
"fatty",
"acid",
"binding",
"protein",
"(",
"aP2",
")",
",",
"and",
"is",
"a",
"key",
"regulator",
"of",
"adipocyte",
"differentiation",
"."
] |
[
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4625
|
[
"PPARgamma",
"is",
"also",
"expressed",
"in",
"hematopoietic",
"cells",
"and",
"is",
"up",
"-",
"regulated",
"in",
"activated",
"monocytes",
"/",
"macrophages",
"."
] |
[
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4626
|
[
"Activation",
"of",
"PPARgamma",
"may",
"play",
"a",
"role",
"in",
"the",
"induction",
"of",
"differentiation",
"of",
"macrophages",
"to",
"foam",
"cells",
"that",
"are",
"associated",
"with",
"atherosclerotic",
"lesions",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4627
|
[
"We",
"report",
"that",
"both",
"natural",
"and",
"synthetic",
"PPARgamma",
"agonists",
"induce",
"time",
"-",
"and",
"dose",
"-",
"dependent",
"increases",
"in",
"aP2",
"mRNA",
"in",
"both",
"primary",
"human",
"monocytes",
"and",
"the",
"monocytic",
"cell",
"line",
",",
"THP",
"-",
"1",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4628
|
[
"These",
"data",
"suggest",
"that",
"PPARgamma",
"activation",
"may",
"play",
"a",
"role",
"in",
"monocyte",
"differentiation",
"and",
"function",
"analogous",
"to",
"its",
"well",
"-",
"characterized",
"role",
"in",
"adipocytes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4629
|
[
"Identification",
"of",
"a",
"physical",
"interaction",
"between",
"calcineurin",
"and",
"nuclear",
"factor",
"of",
"activated",
"T",
"cells",
"(",
"NFATp",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O"
] |
4630
|
[
"In",
"T",
"lymphocytes",
",",
"the",
"calcium",
"/",
"calmodulin",
"-",
"dependent",
"serine",
"/",
"threonine",
"phosphatase",
",",
"calcineurin",
",",
"plays",
"a",
"pivotal",
"role",
"in",
"transducing",
"membrane",
"-",
"associated",
"signals",
"to",
"the",
"nucleus",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4631
|
[
"One",
"of",
"the",
"putative",
"targets",
"of",
"calcineurin",
"is",
"the",
"pre",
"-",
"existing",
",",
"cytosolic",
"component",
"of",
"the",
"nuclear",
"factor",
"of",
"activated",
"T",
"cells",
"(",
"NFATp",
";",
"also",
"referred",
"to",
"as",
"NFAT1",
")",
",",
"which",
"is",
"one",
"of",
"several",
"transcription",
"factors",
"required",
"for",
"the",
"expression",
"of",
"interleukin",
"2",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
4632
|
[
"Inhibition",
"of",
"calcineurin",
"by",
"the",
"immunosuppressive",
"drugs",
"cyclosporin",
"A",
"and",
"FK506",
"prevents",
"dephosphorylation",
"of",
"NFATp",
"and",
"its",
"translocation",
"to",
"the",
"nucleus",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4633
|
[
"However",
",",
"a",
"physical",
"interaction",
"between",
"calcineurin",
"and",
"NFATp",
"has",
"not",
"been",
"demonstrated",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4634
|
[
"Here",
"we",
"demonstrate",
"the",
"binding",
"of",
"NFATp",
"from",
"lysates",
"of",
"T",
"cells",
"to",
"immobilized",
"calcineurin",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
4635
|
[
"Of",
"note",
",",
"both",
"the",
"phosphorylated",
"and",
"the",
"dephosphorylated",
"form",
"of",
"NFATp",
"bound",
"to",
"calcineurin",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
4636
|
[
"Furthermore",
",",
"the",
"binding",
"of",
"both",
"forms",
"of",
"NFATp",
"to",
"calcineurin",
"was",
"inhibited",
"by",
"pretreatment",
"of",
"calcineurin",
"with",
"a",
"complex",
"of",
"FK506",
"and",
"its",
"ligand",
"FKBP12",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4637
|
[
"Taken",
"together",
"these",
"data",
"strongly",
"suggest",
"a",
"direct",
"interaction",
"of",
"calcineurin",
"with",
"NFATp",
"and",
"that",
"this",
"interaction",
"does",
"not",
"depend",
"upon",
"the",
"phosphorylation",
"sites",
"of",
"NFATp",
"affected",
"by",
"activation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4638
|
[
"Cross",
"-",
"linking",
"CD40",
"on",
"B",
"cells",
"preferentially",
"induces",
"stress",
"-",
"activated",
"protein",
"kinases",
"rather",
"than",
"mitogen",
"-",
"activated",
"protein",
"kinases",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
4639
|
[
"The",
"activation",
"is",
"rapid",
"and",
"transient",
"and",
"is",
"mediated",
"through",
"a",
"cyclosporin",
"A",
"-",
"insensitive",
"pathway",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4640
|
[
"Furthermore",
",",
"this",
"signaling",
"pathway",
"appears",
"not",
"to",
"rely",
"on",
"protein",
"kinase",
"C",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
4641
|
[
"While",
"CD40",
"ligation",
"strongly",
"activates",
"the",
"SAPKs",
"(",
"up",
"to",
"25",
"-",
"fold",
")",
",",
"it",
"does",
"not",
"affect",
"members",
"of",
"the",
"mitogen",
"-",
"activated",
"protein",
"kinase",
"family",
"(",
"MAPK",
";",
"ERK1",
"and",
"ERK2",
")",
"."
] |
[
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O"
] |
4642
|
[
"Consistent",
"with",
"these",
"data",
",",
"CD40",
"signals",
"up",
"-",
"regulate",
"c",
"-",
"jun",
"but",
"not",
"c",
"-",
"fos",
"mRNA",
"and",
"alter",
"the",
"transcription",
"factor",
"ATF2",
"but",
"not",
"the",
"Raf",
"-",
"1",
"protein",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
4643
|
[
"Stimulation",
"of",
"the",
"T",
"-",
"cell",
"antigen",
"receptor",
"-",
"CD3",
"complex",
"signaling",
"pathway",
"by",
"the",
"tyrosine",
"phosphatase",
"inhibitor",
"pervanadate",
"is",
"mediated",
"by",
"inhibition",
"of",
"CD45",
":",
"evidence",
"for",
"two",
"interconnected",
"Lck",
"/",
"Fyn",
"-",
"or",
"zap",
"-",
"70",
"-",
"dependent",
"signaling",
"pathways",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4644
|
[
"The",
"tyrosine",
"phosphatase",
"specific",
"inhibitor",
"pervanadate",
"is",
"a",
"potent",
"activator",
"of",
"T",
"lymphocytes",
"through",
"induction",
"of",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"and",
"downstream",
"events",
"of",
"the",
"activation",
"cascade",
"."
] |
[
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4645
|
[
"By",
"contrast",
",",
"stimulation",
"of",
"calcium",
"influx",
",",
"a",
"CD3",
"-",
"dependent",
"event",
",",
"paralleled",
"zap",
"-",
"70",
"activation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
4646
|
[
"The",
"data",
"demonstrate",
"that",
"the",
"T",
"-",
"cell",
"antigen",
"receptor",
"-",
"CD3",
"(",
"TcR",
"-",
"CD3",
")",
"complex",
"is",
"functionally",
"linked",
"to",
"two",
"different",
"protein",
"tyrosine",
"kinase",
"(",
"PTK",
")",
"modules",
"with",
"separate",
"specific",
"functions",
"and",
"that",
"CD45",
"may",
"be",
"an",
"important",
"regulator",
"of",
"this",
"coupling",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4647
|
[
"Vitamin",
"D",
"analogs",
",",
"20",
"-",
"Epi",
"-",
"22",
"-",
"oxa",
"-",
"24a",
",",
"26a",
",",
"27a",
",",
"-",
"trihomo",
"-",
"1alpha",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2",
"-",
"vitamin",
"D3",
",",
"1",
",",
"24",
"(",
"OH",
")",
"2",
"-",
"22",
"-",
"ene",
"-",
"24",
"-",
"cyclopropyl",
"-",
"vitamin",
"D3",
"and",
"1alpha",
",",
"25",
"(",
"OH",
")",
"2",
"-",
"lumisterol3",
"prime",
"NB4",
"leukemia",
"cells",
"for",
"monocytic",
"differentiation",
"via",
"nongenomic",
"signaling",
"pathways",
",",
"involving",
"calcium",
"and",
"calpain",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4648
|
[
"Side",
"-",
"chain",
"modified",
"vitamin",
"D",
"analogs",
"including",
"20",
"-",
"Epi",
"-",
"22",
"-",
"oxa",
"-",
"24a",
",",
"26a",
",",
"27a",
"-",
"trihomo",
"-",
"1alpha",
",",
"2",
"5",
"-",
"dihydroxyvitamin",
"D3",
"(",
"KH1060",
")",
",",
"and",
"1",
",",
"24",
"-",
"dihydroxy",
"-",
"22",
"-",
"ene",
"-",
"24",
"-",
"cyclopropyl",
"-",
"vitamin",
"D3",
"(",
"MC903",
")",
"were",
"originally",
"designed",
"to",
"aid",
"in",
"the",
"treatment",
"of",
"hyperproliferative",
"disorders",
"including",
"psoriasis",
"and",
"cancer",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4649
|
[
"Here",
"we",
"demonstrate",
"that",
"these",
"analogs",
",",
"as",
"well",
"as",
"the",
"6",
"-",
"cis",
"-",
"locked",
"conformer",
",",
"1alpha",
",",
"25",
"-",
"dihydroxy",
"-",
"lumisterol3",
"(",
"JN",
")",
"prime",
"NB4",
"cells",
"for",
"monocytic",
"differentiation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4650
|
[
"Differentiation",
"in",
"response",
"to",
"all",
"analogs",
"was",
"shown",
"to",
"be",
"inhibited",
"by",
"1beta",
",",
"25",
"-",
"dihydroxyvitamin",
"D3",
"(",
"HL",
")",
",",
"the",
"antagonist",
"to",
"the",
"nongenomic",
"activities",
"of",
"1",
",",
"25D3",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4651
|
[
"The",
"full",
"differentiation",
"response",
"with",
"combinations",
"of",
"analogs",
"and",
"TPA",
"was",
"inhibited",
"50",
"%",
"by",
"the",
"membrane",
"permeable",
"Ca2",
"+",
"chelator",
",",
"1",
",",
"2",
"-",
"bis",
"(",
"o",
"-",
"aminophenoxy",
")",
"-",
"ethane",
"-",
"N",
",",
"N",
",",
"N",
"'",
",",
"N",
"'",
"-",
"tetraacetic",
"acid",
"(",
"BAPTA",
"-",
"AM",
")",
"or",
"calpain",
"inhibitor",
"I",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O"
] |
4652
|
[
"These",
"data",
"demonstrate",
"that",
"intracellular",
"free",
"calcium",
"and",
"the",
"calcium",
"-",
"dependent",
"protease",
",",
"calpain",
"play",
"critical",
"roles",
"in",
"monocytic",
"differentiation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4653
|
[
"Intracellular",
"calcium",
"appears",
"to",
"be",
"most",
"critical",
"in",
"the",
"1",
",",
"25D3",
"-",
"priming",
"stage",
"of",
"differentiation",
",",
"while",
"calpain",
"is",
"essential",
"in",
"the",
"TPA",
"maturation",
"response",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4654
|
[
"Neutrophil",
"maturation",
"and",
"the",
"role",
"of",
"retinoic",
"acid",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4655
|
[
"Neutrophil",
"maturation",
"occurs",
"in",
"well",
"defined",
"morphological",
"stages",
"that",
"correlate",
"with",
"the",
"acquisition",
"of",
"molecular",
"markers",
"associated",
"with",
"neutrophil",
"function",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4656
|
[
"A",
"variety",
"of",
"factors",
"are",
"known",
"to",
"play",
"a",
"role",
"in",
"terminal",
"neutrophil",
"maturation",
",",
"including",
"the",
"vitamin",
"A",
"derivative",
",",
"retinoic",
"acid",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4657
|
[
"A",
"role",
"for",
"retinoic",
"acid",
"during",
"neutrophil",
"maturation",
"has",
"been",
"suggested",
"from",
"a",
"variety",
"of",
"sources",
".",
"Here",
"we",
"present",
"a",
"review",
"of",
"the",
"mechanism",
"of",
"retinoic",
"acid",
"receptor",
"action",
"and",
"the",
"major",
"evidence",
"showing",
"that",
"normal",
"retinoid",
"signaling",
"is",
"required",
"for",
"neutrophil",
"maturation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4658
|
[
"Human",
"T",
"-",
"cell",
"lymphotrophic",
"virus",
"type",
"-",
"I",
"tax",
"gene",
"induces",
"secretion",
"of",
"human",
"macrophage",
"inflammatory",
"protein",
"-",
"1alpha",
"."
] |
[
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
4659
|
[
"Human",
"T",
"-",
"cell",
"lymphotropic",
"virus",
"I",
"(",
"HTLV",
"-",
"I",
")",
"encodes",
"for",
"a",
"40",
"-",
"kDa",
"protein",
",",
"Tax",
",",
"which",
"is",
"important",
"for",
"the",
"immortalization",
"of",
"T",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4660
|
[
"In",
"this",
"study",
",",
"we",
"show",
"that",
"MIP",
"-",
"1alpha",
"is",
"selectively",
"expressed",
"and",
"secreted",
"in",
"the",
"tax",
"transfected",
"Jurkat",
"cell",
"line",
"upon",
"mitogen",
"stimulation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O"
] |
4661
|
[
"Expression",
"of",
"MIP",
"-",
"1alpha",
"-",
"R",
"mRNA",
"in",
"these",
"cells",
"suggests",
"an",
"autocrine",
"role",
"for",
"this",
"chemokine",
"in",
"HTLV",
"-",
"I",
"infected",
"T",
"-",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4662
|
[
"Dendritic",
"cells",
"and",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"rheumatoid",
"arthritis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4663
|
[
"Rheumatoid",
"arthritis",
"(",
"RA",
")",
"is",
"a",
"chronic",
"autoimmune",
"inflammatory",
"disease",
"in",
"which",
"unknown",
"arthrogenic",
"autoantigen",
"is",
"presented",
"to",
"CD4",
"+",
"T",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4664
|
[
"The",
"strong",
"association",
"of",
"the",
"disease",
"with",
"an",
"epitope",
"within",
"the",
"HLA",
"-",
"DR",
"chain",
"shared",
"between",
"various",
"alleles",
"of",
"HLA",
"-",
"DR4",
"and",
"DR1",
"emphasizes",
"the",
"importance",
"of",
"antigen",
"presentation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4665
|
[
"This",
"immune",
"response",
"predominantly",
"occurs",
"in",
"the",
"synovial",
"tissue",
"and",
"fluid",
"of",
"the",
"joints",
"and",
"autoreactive",
"T",
"cells",
"are",
"readily",
"demonstrable",
"in",
"both",
"the",
"synovial",
"compartment",
"and",
"blood",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4666
|
[
"Circulating",
"dendritic",
"cells",
"(",
"DC",
")",
"are",
"phenotypically",
"and",
"functionally",
"identical",
"with",
"normal",
"peripheral",
"blood",
"(",
"PB",
")",
"DC",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4667
|
[
"In",
"the",
"synovial",
"tissue",
",",
"fully",
"differentiated",
"perivascular",
"DC",
"are",
"found",
"in",
"close",
"association",
"with",
"T",
"cells",
"and",
"with",
"B",
"cell",
"follicles",
",",
"sometimes",
"containing",
"follicular",
"DC",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4668
|
[
"These",
"perivascular",
"DC",
"migrate",
"across",
"the",
"activated",
"endothelium",
"from",
"blood",
"and",
"receive",
"differentiative",
"signals",
"within",
"the",
"joint",
"from",
"monocyte",
"-",
"derived",
"cytokines",
"and",
"CD40",
"-",
"ligand",
"+",
"T",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4669
|
[
"In",
"the",
"SF",
",",
"DC",
"manifest",
"an",
"intermediate",
"phenotype",
",",
"similar",
"to",
"that",
"of",
"monocyte",
"-",
"derived",
"DC",
"in",
"vitro",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4670
|
[
"DC",
"at",
"many",
"effector",
"sites",
"have",
"a",
"characteristic",
"pattern",
"of",
"infiltration",
"and",
"differentiation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4671
|
[
"It",
"is",
"important",
"to",
"note",
"that",
"the",
"effector",
"response",
"is",
"not",
"self",
"-",
"limiting",
"in",
"RA",
"autoimmune",
"inflammation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4672
|
[
"In",
"this",
"article",
",",
"we",
"argue",
"that",
"the",
"presentation",
"of",
"self",
"-",
"antigen",
"by",
"DC",
"and",
"by",
"autoantibody",
"-",
"producing",
"B",
"cells",
"is",
"critical",
"for",
"the",
"perpetuation",
"of",
"the",
"autoimmune",
"response",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4673
|
[
"Permanently",
"arresting",
"this",
"ongoing",
"immune",
"response",
"with",
"either",
"pharmaceutical",
"agents",
"or",
"immunotherapy",
"is",
"a",
"major",
"challenge",
"for",
"immunology",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4674
|
[
"Thymocyte",
"-",
"thymic",
"epithelial",
"cell",
"interaction",
"leads",
"to",
"high",
"-",
"level",
"replication",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"exclusively",
"in",
"mature",
"CD4",
"(",
"+",
")",
"CD8",
"(",
"-",
")",
"CD3",
"(",
"+",
")",
"thymocytes",
":",
"a",
"critical",
"role",
"for",
"tumor",
"necrosis",
"factor",
"and",
"interleukin",
"-",
"7",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
4675
|
[
"This",
"work",
"aims",
"at",
"identifying",
"the",
"thymocyte",
"subpopulation",
"able",
"to",
"support",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"(",
"HIV",
")",
"replication",
"under",
"the",
"biological",
"stimuli",
"of",
"the",
"thymic",
"microenvironment",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4676
|
[
"In",
"this",
"report",
"we",
"demonstrate",
"that",
"interaction",
"with",
"thymic",
"epithelial",
"cells",
"(",
"TEC",
")",
"induces",
"a",
"high",
"-",
"level",
"replication",
"of",
"the",
"T",
"-",
"tropic",
"primary",
"isolate",
"HIV",
"-",
"1",
"(",
"B",
"-",
"LAIp",
")",
"exclusively",
"in",
"the",
"mature",
"CD4",
"(",
"+",
")",
"CD8",
"(",
"-",
")",
"CD3",
"(",
"+",
")",
"thymocytes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4677
|
[
"Tumor",
"necrosis",
"factor",
"(",
"TNF",
")",
"and",
"interleukin",
"-",
"7",
"(",
"IL",
"-",
"7",
")",
",",
"secreted",
"during",
"this",
"interaction",
",",
"are",
"critical",
"cytokines",
"for",
"HIV",
"long",
"terminal",
"repeat",
"transactivation",
"through",
"NF",
"-",
"kappaB",
"-",
"dependent",
"activation",
"."
] |
[
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4678
|
[
"TNF",
"is",
"the",
"major",
"inducer",
"of",
"NF",
"-",
"kappaB",
"and",
"particularly",
"of",
"the",
"p50",
"-",
"p65",
"complex",
",",
"whereas",
"IL",
"-",
"7",
"acts",
"as",
"a",
"cofactor",
"by",
"sustaining",
"the",
"expression",
"of",
"the",
"p75",
"TNF",
"receptor",
"."
] |
[
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
4679
|
[
"The",
"requirement",
"for",
"TNF",
"is",
"further",
"confirmed",
"by",
"the",
"observation",
"that",
"the",
"inability",
"of",
"the",
"intermediate",
"CD4",
"(",
"+",
")",
"CD8",
"(",
"-",
")",
"CD3",
"(",
"-",
")",
"thymocytes",
"to",
"replicate",
"the",
"virus",
"is",
"associated",
"with",
"a",
"defect",
"in",
"TNF",
"production",
"during",
"their",
"interaction",
"with",
"TEC",
"and",
"correlates",
"with",
"the",
"absence",
"of",
"nuclear",
"NF",
"-",
"kappaB",
"activity",
"in",
"these",
"freshly",
"isolated",
"thymocytes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4680
|
[
"Addition",
"of",
"exogenous",
"TNF",
"to",
"the",
"intermediate",
"thymocyte",
"cultures",
"induces",
"NF",
"-",
"kappaB",
"activity",
"and",
"is",
"sufficient",
"to",
"promote",
"HIV",
"replication",
"in",
"the",
"cocultures",
"with",
"TEC",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4681
|
[
"Together",
",",
"these",
"data",
"suggest",
"that",
"in",
"vivo",
",",
"despite",
"an",
"efficient",
"entry",
"of",
"the",
"virus",
"in",
"all",
"the",
"CD4",
"(",
"+",
")",
"subpopulations",
",",
"a",
"high",
"viral",
"load",
"may",
"be",
"generated",
"exclusively",
"within",
"the",
"mature",
"CD4",
"(",
"+",
")",
"CD8",
"(",
"-",
")",
"CD3",
"(",
"+",
")",
"subset",
"of",
"thymocytes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4682
|
[
"However",
",",
"under",
"conditions",
"of",
"inflammatory",
"response",
"after",
"infection",
",",
"TNF",
"might",
"also",
"be",
"present",
"in",
"the",
"intermediate",
"thymocyte",
"compartment",
",",
"leading",
"to",
"efficient",
"HIV",
"replication",
"in",
"these",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4683
|
[
"NF",
"-",
"kappaB",
"-",
"mediated",
"up",
"-",
"regulation",
"of",
"Bcl",
"-",
"x",
"and",
"Bfl",
"-",
"1",
"/",
"A1",
"is",
"required",
"for",
"CD40",
"survival",
"signaling",
"in",
"B",
"lymphocytes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4684
|
[
"Many",
"of",
"the",
"effects",
"of",
"CD40",
"are",
"believed",
"to",
"be",
"achieved",
"through",
"altered",
"gene",
"expression",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4685
|
[
"In",
"addition",
"to",
"Bcl",
"-",
"x",
",",
"a",
"known",
"CD40",
"-",
"regulated",
"antiapoptotic",
"molecule",
",",
"we",
"identified",
"a",
"related",
"antiapoptotic",
"molecule",
",",
"A1",
"/",
"Bfl",
"-",
"1",
",",
"as",
"a",
"CD40",
"-",
"inducible",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
4686
|
[
"Inhibition",
"of",
"the",
"NF",
"-",
"kappaB",
"pathway",
"by",
"overexpression",
"of",
"a",
"dominant",
"-",
"active",
"inhibitor",
"of",
"NF",
"-",
"kappaB",
"abolished",
"CD40",
"-",
"induced",
"up",
"-",
"regulation",
"of",
"both",
"the",
"Bfl",
"-",
"1",
"and",
"Bcl",
"-",
"x",
"genes",
"and",
"also",
"eliminated",
"the",
"ability",
"of",
"CD40",
"to",
"rescue",
"Fas",
"-",
"induced",
"cell",
"death",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4687
|
[
"Within",
"the",
"upstream",
"promoter",
"region",
"of",
"Bcl",
"-",
"x",
",",
"a",
"potential",
"NF",
"-",
"kappaB",
"-",
"binding",
"sequence",
"was",
"found",
"to",
"support",
"NF",
"-",
"kappaB",
"-",
"dependent",
"transcriptional",
"activation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4688
|
[
"Furthermore",
",",
"expression",
"of",
"physiological",
"levels",
"of",
"Bcl",
"-",
"x",
"protected",
"B",
"cells",
"from",
"Fas",
"-",
"mediated",
"apoptosis",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"NF",
"-",
"kappaB",
"signaling",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
4689
|
[
"Thus",
",",
"our",
"results",
"suggest",
"that",
"CD40",
"-",
"mediated",
"cell",
"survival",
"proceeds",
"through",
"NF",
"-",
"kappaB",
"-",
"dependent",
"up",
"-",
"regulation",
"of",
"Bcl",
"-",
"2",
"family",
"members",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
4690
|
[
"Stimulation",
"of",
"neutrophil",
"interleukin",
"-",
"8",
"production",
"by",
"eosinophil",
"granule",
"major",
"basic",
"protein",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
4691
|
[
"We",
"evaluated",
"the",
"ability",
"of",
"eosinophil",
"granule",
"major",
"basic",
"protein",
"(",
"MBP",
")",
"to",
"stimulate",
"interleukin",
"(",
"IL",
")",
"-",
"8",
"production",
"by",
"neutrophils",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4692
|
[
"Incubation",
"with",
"2",
"microM",
"MBP",
"showed",
"that",
",",
"after",
"a",
"1",
"h",
"lag",
",",
"the",
"level",
"of",
"IL",
"-",
"8",
"release",
"increased",
"with",
"time",
"for",
"approximately",
"10",
"h",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4693
|
[
"At",
"the",
"2",
"microM",
"concentration",
",",
"eosinophil",
"cationic",
"protein",
",",
"eosinophil",
"-",
"derived",
"neurotoxin",
",",
"and",
"eosinophil",
"peroxidase",
"did",
"not",
"stimulate",
"significant",
"levels",
"of",
"IL",
"-",
"8",
"production",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
4694
|
[
"MBP",
"stimulated",
"2",
"-",
"fold",
"increases",
"in",
"IL",
"-",
"8",
"messenger",
"RNA",
"(",
"mRNA",
")",
"after",
"1",
"and",
"3",
"h",
"of",
"incubation",
",",
"which",
"were",
"blocked",
"by",
"pretreatment",
"with",
"actinomycin",
"D",
"."
] |
[
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4695
|
[
"However",
",",
"stimulation",
"with",
"MBP",
"did",
"not",
"produce",
"an",
"increase",
"in",
"the",
"binding",
"activity",
"of",
"nuclear",
"factor",
"(",
"NF",
")",
"-",
"kappaB",
"or",
"activator",
"protein",
"-",
"1",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
4696
|
[
"No",
"NF",
"-",
"IL",
"-",
"6",
"binding",
"activity",
"was",
"detected",
"in",
"the",
"same",
"nuclear",
"extracts",
"."
] |
[
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4697
|
[
"In",
"addition",
",",
"stimulation",
"with",
"MBP",
"prolonged",
"the",
"stability",
"of",
"IL",
"-",
"8",
"mRNA",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
4698
|
[
"These",
"findings",
"indicate",
"that",
"MBP",
"is",
"selective",
"among",
"the",
"eosinophil",
"granule",
"proteins",
"as",
"a",
"stimulus",
"for",
"neutrophil",
"IL",
"-",
"8",
"release",
"and",
",",
"further",
",",
"that",
"stimulation",
"of",
"neutrophil",
"IL",
"-",
"8",
"release",
"by",
"MBP",
"involves",
"both",
"transcriptional",
"and",
"posttranscriptional",
"regulation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4699
|
[
"We",
"postulate",
"that",
"MBP",
"-",
"induced",
"release",
"of",
"IL",
"-",
"8",
"by",
"neutrophils",
"may",
"contribute",
"to",
"the",
"pathophysiology",
"of",
"acute",
"asthma",
"and",
"other",
"inflammatory",
"lung",
"diseases",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
4700
|
[
"Expression",
"of",
"either",
"the",
"TCL1",
"oncogene",
",",
"or",
"transcripts",
"from",
"its",
"homologue",
"MTCP1",
"/",
"c6",
".",
"1B",
",",
"in",
"leukaemic",
"and",
"non",
"-",
"leukaemic",
"T",
"cells",
"from",
"ataxia",
"telangiectasia",
"patients",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.